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Bodio liegt in der unteren Leventina im Tal des Ticino. Das Gemeindegebiet erstreckt sich vom Tal bis hoch zum Gebirgspass Bassa dei Cantói auf 1'935 m ü. M., dem Übergang zum Bleniatal. Mit dem Bau der Gotthardbahn in den 1880er Jahren und dem Beginn der Nutzung der Wasserkraft des Ticino wandelte sich die landwirtschaftlich geprägte Gemeinde zu einem wichtigen und modernen Industriezentrum. Bis auf eine Weinbaufläche, gibt es heute keine Landwirtschaft mehr auf dem Gemeindegebiet. Am Ostrand der Gemeinde liegt das Südportal des 2016 eröffneten Gotthard-Basistunnels.