Zur Gemeinde Werthenstein gehören das südlich der Kleinen Emme liegende Werthenstein-Oberdorf, sowie die Ortsteile Schachen und Wolhusen-Markt. Die Gemeindegrenze verläuft entlang der Kleinen Emme und anderen Gewässern. Das ehemalige Kloster mit Wallfahrtskirche in Werthenstein wird besonders von St. Jakobspilgern besucht. Ältester Ortsteil der Gemeinde ist Wolhusen-Markt, der bis heute seine traditionellen Marktrechte behalten hat. Im 11. Jahrhundert wurden hier eine kleine Burg und eine Brücke über die Kleine Emme errichtet.
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