Die Gemeinde Pleigne liegt auf 809 m ü. M. im Distrikt Delémont an der Grenze zu Frankreich in der Hügellandschaft des nördlichen Juras. Die Gemeinde ist sehr abgelegen und nur durch kleinere Strassen mit ihren Nachbarorten verbunden. Nördlich des Dorfs steht der Panoramaturm Pleigne mit guter Sicht über die diversen Hügel des Juras.
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